Escribo mas claro que el agua y aun así no lo entiendes o buscas tres pies al gato. ¿Entonces si yo escribiera como lo haces tu? ¡IMAGÍNATE!.
En fin... te lo repetiré de nuevo. Si presionas una vez esa combinación de teclas (ALT+E) se activa el modo dual y así te lo muestra el rufus en su barra de estado durante un instante. Y si quieres desactivar dicho modo dual pues vuelve a presionar esa combinación de teclas, y de nuevo el rufus así te lo mostrará en su barra de estado.
Así que tu crea el pendrive como quieras, ya sabes como hacerlo activando el modo dual, o desctivandolo según lo que desees.
Saludos...
Songoku