La única duda que tengo es saber si tus imágenes tienen los tamaños correctos, es decir, el resultado sería el siguiente (He reducido el tamaño de las imágenes a la mitad para que se aprecie mejor):
Imagen 01:
Imagen 02:
Imagen resultante:
Eso es porque tu imagen 02 es mucho más grande (no ignorar la transparencia). Si no tienes problemas con esto vas y te descargas ImageMagick: https://download.imagemagick.org/ImageMagick/download/binaries/ImageMagick-7.1.0-portable-Q16-HDRI-x86.zip
Dentro está el composite.exe solo lo necesitas a él así que ponlo junto con tus imágenes, por ejemplo:
Ahora te descargas este Script que se encargará de hacer todo el trabajo, tienes que colocarlo igual en la misma carpeta de tus imágenes y simplemente darle doble click, él creará una nueva carpeta Resultado con las imágenes sobrepuestas
https://mega.nz/file/4ooEjQCb#a3pS_MNvkKbcJoaAcDhuighmyMRJoeYL2fZR-Ssz8oI
Listo, con eso deberías solucionar tu problema. Otra opción es crear un Script javascript para Photoshop pero eso ya conlleva algo más de elaboración XD.
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Contenido del Script:
Código