Yo llevo ya un buen tiempo programando en Java en Android Studio y estoy aprendiendo bastante y como consecuencia ye me he habituado a este lenguaje.
Respecto a C#, algo he tocado, no mucho pero si algo...
Respecto a C#, algo he tocado, no mucho pero si algo...
Entonces tu pregunta queda respondida con tus preferencias, sigue con Java, a menos que te guste mucho más utilizar C# para programar.
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Básicamente he creado este tema por mi duda, ya que como he comentado anteriormente, me he encontrado con la sorpresa de que hay desarrolladores que informan de que algunas app para Android están hechas en C#
Claro que si, las hay en C#, y en VB.Net (e incluso escritas en otros lenguajes menores derivados de BASIC también, con basic4android, pero no merece la pena mencionar esa basura de IDE).
Si te gusta la programación con C#, y si le sabes sacar partido a la mejor IDE existente (indiferentemente de los lenguajes soportados), es decir, Microsoft Visual Studio, entonces si que deberías considerar darle una opción al desarrollo bajo la plataforma .Net, ya que tienes una excelente herramienta de desarrollo para Android bajo C# (y parcialmente VB.Net) con integración para Visual Studio:
➢ Xamarin For Visual Studio
También tienes la versión standalone, Xamarin Studio:
➢ Xamarin Studio
Y también tienes a tu disposición una infinidad de herramientas profesionales como por ejemplo el set de controles RAD de Telerik para Xamarin Studio/Xamarin For Visual Studio.
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incluso hay convertidores o "adaptadores" que ingresas el código de tu aplicación hechas en Java y automaticamente te la convierte a C# (algo que a simple vista parece complejo de hacer...)
Por supuesto, pero ese tipo de conversiones encuentran complicaciones en códigos complejos, no esperes que siempre sean capaces de realizar una traducción 100% idéntica y funcional. como tu has dicho es dificil.
Las aplicaciones de Tangible son de lo mejorcito que existe para este tipo de conversiones, y aun así no es nada perfecto:
➢ Tangible Code Converters
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de ahí mi duda de por qué la gente programa apps en C#, si había alguna diferencia o algo...
¿Diferencia entre...?, ¿entre desarrollar una app en C# o en Java?, ¿diferencias de que tipo exactamente?, las diferencias visuales depende del framework que utilices para construir la UI claro está, y sobre las diferencias internas pues...:
Sobre Android internamente no se mucho, pero por como trabaja el compilador de Xamarin deduzco que apenas debe existir alguna ínfima diferencia de rendimiento, hoy en día la gente dice "Virtual Machine" y se echan las manos a la cabeza como si fuera algo terrible que se deba evitar, pero bueno, así es como creo que trabaja más o menos Xamarin:
Compilación:
- El compilador que se utiliza es Mono.
- El código C#/VB.Net se compila a código máquina (machine code).
Ejecución:
- Para la ejecución del código máquina no se utiliza el JIT de .Net, sino AOT.
- El runtime y VM de android (ART) automaticamente genera unas classes de Java conocidas como Android Callable Wrappers (ACW)
lo que sirve para que el runtime y VM de Mono se comunique de ida y vuelta con ART, y vice versa,
esa es la base de la interoperabilidad entre Mono y Android:

Aquí tienes algo más de información general:
➢ Part 1 – Understanding the Xamarin Mobile Platform - Xamarin
Aquí tienes un ejemplo más claro de lo que sucede internamente en la ejecución del código nativo compilado y empacado en la .app:
➢ Android Callable Wrappers. Implementation Details - Xamarin
Aparte de eso, Xamarin tiene algunas limitaciones:
➢ Limitations - Xamarin
Yo jamás utilizaría Java para desarrollar una app de Android (ni una app de nada), no por que sea malo obviamente sería la opción más natural usar Java para una app de Android, pero es que mi entorno de desarrollo es otro, es .Net, y aquí ya existen herramientas maravillosas que sacan todo el beneficio a mi calidad y experiencia de programación, cosa que en Java sería todo lo contrario ya que acabaría disminuyendo mi rendimiento de trabajo en todos los aspectos al ser un mundo un poco desconocido en el que empezar desde Cero.
Por eso te digo, que deberías basar tu elección entre C# o Java según las comodidades que encuentes al usar las IDEs y herramientas que existen para ambos lenguajes, tan simple como eso, no hay que fijarse en nada más, ni si uno es mejor que el otro o blah blah blah, ambos son lenguajes excelentes y con herramientas excelentes, basa tu elección en otros factores, si te gusta java y lo ves cómodo entonces no cambies por que no te hace falta.
Un saludo.