Una variable extern significa que existe, pero está en otro lugar. Si declaras una variable extern y luego no la declaras de forma normal, verás que te da una "undefined reference" al enlazar. Es porque no encuentra su declaración.

Como detalle:

while(1) send(fd_client, "hola", 100, 0);

El tercer argumento es el tamaño de la cadena. En este caso, debería ser 4, o 5 si quieres enviar el caracter nulo.

A parte de eso: en el header declaras fd, fd_client y fs_server, como extern. En los main, debes usar esas variables. No tienes que declararlas de nuevo: ya están declaradas en ss.c. Quita las declaraciones de esas variables en los main, y prueba de nuevo.

En ese caso, hay un punto en el que el socket deja de funcionarte. Y puede ser, o porque el servidor cerró la conexión, o por problemas al abrirla. ¿Hay algún punto en el que funcione la entrada/salida del socket?

Si necesitas limpiar la consola, system("cls") sirve bien. Usar la API del Sistema Operativo acabaría complicando un proyecto simple, y haciéndolo funcional solo en ese SO.
System("cls") o system("clear") sirven bien, por qué no usarlos. Al fin y al cabo, la consola no pertenece a tu programa; no tiene sentido gastar recursos en buscar "otra forma".

Coloca paréntesis:

if((numbytes=recv(fd,buf,100,0))==-1)

strtok trabaja con cadenas de caracteres (char*), no con string. El retorno, es un char*.

Veo que estás usando cabeceras de C y a la vez, C++. Las cabeceras de C++ son como las de C, pero con una 'c' al principio, y sin el ".h": <math.h> - <cmath>

Si quieres trabajar con string, puedes usar métodos de la clase striong como find() o substr(), para encontrar el índice de un caracter y para obtener una sub-cadena, respectivamente.

Se supone que para eso sirven los BigInt no? xD

arreglo == &(arreglo[0])

Eso sí. Lo otro, pues no, salvo que se refiriese a otra cosa. arreglo[0] es el elemento 0. &arreglo[0] es la dirección del elemento 0, osea, el valor de 'arreglo'.

Utiliza este código:

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
 
int main() {
	FILE *archivo;
	int c;
 
	archivo=fopen("asd.txt","r+");
	if (archivo == NULL){
		printf("\nError de apertura del archivo. \n\n");
	}
	else {		
		c=fgetc(archivo);
		while (c != EOF) {
			if (c==',') {
				printf("%i ", ftell(archivo));
				fseek(archivo, -1, SEEK_CUR);
				printf("%i ", ftell(archivo));
				fputc('.',archivo);
				fflush(archivo);
				printf("%i\n", ftell(archivo));
			}
			c=fgetc(archivo);
		}
	}
	fclose(archivo);
}

Le añadí unos printf para comprobar que la posición del cursor varíe correctamente.
Te debería salir por pantalla los valores:
"N N-1 N"

Extraño. ¿Usas Windows, Linux?