Hola, visto tu problema tan particular, podrían pensar que son varias posibles causas pero al leer que las soluciones de las mismas ya la has probado, entonces las descarto, por ejemplo que alguna entrada USB de tu CPU pueda estar en corto o fallando pero si has probado en todas las disponibles, entonces ese no es el problema.
Yo creo que el Windows está corrupto y deberías probar también con otro Pen Drive.
También he pensado que puede ser la placa madre en el peor de los casos, pero por lo visto funciona bien.
Vuelvo a repetir para mí el problema es que está dañado ese Windows o el Pen Drive o incluso los dos.
También puede llegar a ser que algún dispositivo esté mal conectado, es decir con una ficha que tenga un voltaje distinto o un cable de datos (banda de cables) que debería ir en otro lado.
Si ese CPU tiene una lectora/grabadora de CD/DVD, prueba a desconectarla completamente es decir los cables del voltaje o los cables de datos (no la desmontes del gabinete/torre), luego prueba de nuevo a instalar Windows, PERO no sin antes de usar otro Pen Drive y otro Windows.
Saludos