Olvidé decirte que si al reinstalar Debian (o cualquier distribución GNU/Linux) montas tu partición home sin eliminarla ni formatearla, y usas el mismo nombre de usuario, volverás a tener todos tus archivos y configuraciones sin esfuerzo.
Por eso es que te recomendaba que mantuvieras tus datos en tu home ya que todo es mas sencillo.... si solo usas Linux.
Claro está que no contaba con que tuvieras que acceder desde "Wentanas".
Es correcto tu consejo, solo que a veces puede causar algun error al momento de montar esta /home con una nueva distro, si sufres de versionitis y te gusta andar probando una y otra.
9tNIX Te recomendaria crear a las clásicas /,/home y SWAP la partición /media/datos para que ahi vayas guardando tu data importante (documentos, música, videos, porno, etc), y cada vez que mudes de distro solo montas esta particion y listo, asi evitar dolores de cabeza.
Saludos.