Suponiendo que solo uses virtualizadores comunes o de tipo 2, VirualBox, VmWare, Qemu, por citar algunos
El software de virtualizacion corre como una aplicacion sobre el sistema operativo sobre el que se instala ?Exactamente, tomando las condiciones que tu le des a estas maquinas virtuales que haz creado
Una vez instalado el Hipervisor se instalan sobre él los distintos sistemas operativos que van a correr sobre él, no?
Y el sistema sobre el que se instaló el Hipervisor? se pierde ?Al crear la maquina virtual, este toma un espacio de tu HDD designado por ti o autómatico para instalar un S.O en otras palabras es como si fuera un HDD diferente, pero que obviamente no podras utilizar desde el S:O anfitrión.
Si yo instalé el Hipervisor sobre XP por ejemplo, y quiero una vez instaldo el Hipervisor funcionar con XP, tengo que volver a instalarlo ?No, solo minimizar la aplicación y continuar con tu trabajo en el sistema anfitrion.
Ahora te digo que existen 2 tipos de Hipervisor, el "comun" o tipo 2 son los que se usa en casa, como VirtualBOX, VmWare, Qemu, etc (estos funcionan como aplicaion )y el conocido como tipo 1 Xen, Citrix, etc; (estos directamente al hardware) te dejo un enlace de wikipedia para que te enteres demás:
http://es.wikipedia.org/wiki/HipervisorSaludos.