El error menciona un ArrayIndexOutOfBoundsException, lo que quiere decir es que de alguna forma le estas dando un indice que no se existe.
Por lo que donde esta mal es la forma en que recorre el indice.

Del ultimo for tienes que corrergirlo así:



Esto es por que los indices de un arreglo se comienzan a contar desde el cero, ejemplo:

A = [1,2,3,4,5];

donde A.length es 5, pero el index inicial es A[0] = 1 y asi hasta A[4] = 5

Este es un buen libro para empezar.

http://www.amazon.com/Introduction-Algorithms-Thomas-H-Cormen/dp/0262033844

Los algoritmos basicos son con estructuras, como son arboles de deciciones, arboles RojiNegros, etc.

Por que muchos problemas se pasan a representar a estas estructuras para un manejo mucho mas sencillo.

Mira todo lo que son las funciones básicas del S.O, se pueden hacer en ASM y C, las demás aplicaciones se pueden hacer con C++, y siento que puede ser mejor opción que Python.

Es eficiente por que la complejidad del algoritmo de ordenacion es O(nlogn) mas checar si alguno se repitio, que no toma O(n), por lo que la complejidad es O(nlogn + n)

Mientras que verificando si alguno se repitió nos toma O(n^2).

Y yo estoy completamente de acuerdo, con java no aprendes nada de las cosas que acabas de mecionar.
Pero aun así la sintaxis se baso en C++.

Cuales son las de spot.pl que has resuelto?

Estoy de acuerdo con Littlehorse, en mi caso yo odio ASM, y como no tengo la necesidad de aprenderlo, pues no tengo ni ganas de aprenderlo.

La sintaxis de java esta insipirada en C++, por lo que si tiene algo que ver.

Encontre este tutorial que contiene código fuente para que lo puedas probar.

http://www.cokeandcode.com/info/tut2d.html

Pero casi nadie postea sobre Algoritmos, y aunque yo no tengo mucho tiempo para estar contribuyendo, me gustaría de vez en cuando ver hilos sobre estos temas.

OpenSuse es una buena distribucion, pero si quieres aprender un poco mas, esta muy bien ArchLinux, que te quitara tiempo, pero aprenderas mucho.
Si tienes mas ganas de parender instalate CentOs te tomara como una semana hacerlo arrancar, pero aprenderas como no tienes idea.