Bueno, a ver. Aquí hay dos conceptos diferentes, uno sería lo que es electrónica y la otra la parte "de ordenador"
Lo primero que tenemos que tener en cuenta en este tinglado, es que un ordenador al final es un "circuito digital" muy grande y complejo, pero la base de funcionamiento es la misma.
Hay una rama de la electrónica que toca estos temas: La electrónica digital. Esta se diferencia de la analógica en que funciona en base a estados discretos.
Esto dicho así no aclara nada, pero veamos un ejemplo de cada tipo. La electrónica analógica es "la de toda la vida". Por ejemplo una radio de las antiguas, una mesa de mezclas, un amplificador de guitarra, etc. En este caso trabajamos con variaciones de voltaje e intensidad. Un casette por ejemplo captura las variaciones de voltaje en un micrófono, las amplifica y las graba en una cinta usando otro dispositivo. Aquí hay un voltaje de trabajo y el "cero" que es la masa del circuito. Es como un reostato con una bombilla, a mas intensidad de voltaje mas se ilumina la bombilla.
La electrónica digital funciona de otro modo, en estados de "o hay voltaje o no lo hay". Como debemos de tener un umbral a partir del cual se asume que "si hay voltaje" este se establece generalmente de forma arbitraria (es decir: porque si) en +5 voltios.
Esto no es para nada exclusivo de los ordenadores, se usa en electrónica para automatismos "de toda la vida". Eso incluye desde mecanismos simples como pueda ser un dispositivo temporizador para una puerta de garaje, riego de jardines, etc... esta rama de la electrónica funciona con agrupaciones de transistores que forman lo que se conoce como "puertas lógicas" y su diseño se basa sobre todo en una rama de las matemáticas conocida como algebra booleana
https://es.wikipedia.org/wiki/%C3%81lgebra_de_Boole¿Y que tiene esto que ver con los ordenadores? Pues que un ordenador esta compuesto por este tipo de electrónica. Literalmente miles de millones de transistores formando puertas lógicas y otros elementos que hacen lo que se conoce habitualmente como "maquina universal de Turing"
https://es.wikipedia.org/wiki/M%C3%A1quina_de_TuringEsto no se ha parido de la nada, los ordenadores llevan años evolucionando desde algunos muy sencillos, que incluso podías montar tu mismo (soldando los componentes) hasta el día de hoy donde hay monstruos con miles de procesadores, cada uno de ellos con miles de millones de transistores.
Esa es la parte electrónica, pero ¿y como sabe donde empieza y termina la información?
Esto se relaciona con ese reloj que te mencionan antes, y con una serie adicional de bits adicionales en ocasiones, sumas de verificación y otros métodos. No existe uno único ya que cada protocolo en los que se comunica información entre dos puntos usa uno diferente de acuerdo con sus necesidades. Es complicado especificar como se hace en cada caso porque depende de la arquitectura e incluso del sistema operativo en otros casos, del protocolo de comunicación, etc.
Los datos viajan en "unos y ceros" entre diferentes partes y componentes constantemente. De la memoria del ordenador a la cpu y viceversa, entre el ordenador y sus periféricos, a través de diferentes redes, etc.
Pero el que haya cada segundo literalmente miles de millones de señales corriendo por ahí no es que sea "imposible de entender", es lo mismo que en un ordenador mas sencillo.
Por ponerlo en claro. En principio no hay diferencia entre un ordenador de los años 80 que podía tener unos 3500 transistores en su cpu y uno moderno que tenga 5000 millones (como por ejemplo la cpu de una XBOX One. Simplemente hay "mas de lo mismo". El principio por el que funcionan no ha variado en esencia desde el primer día