veamos:
               es verdad que mejoran el código(siguen faltando líneas o mejoras), pero agregare algo a lo hecho hasta ahora:

#-*- coding: utf - 8 -*-
contador = 3
while contador != 0:
    usuario = input("Introduce el usuario:")
    if usuario == "root":
        contraseña = input("Introduce la contraseña:")
        if contraseña == "123":
            print("Bienvenido señor X")
            break
        else:    #este else lo agrego porque si user esta bien pero password mal, se repite indefinidamente sin usar el contador de intentos
            contador -= 1
            print(f" ERROR \n Quedan: {contador} intentos ") #acá uso formato de cadenas, hace más legible el código.        
    else:
        contador -= 1
        print(f" ERROR \n Quedan: {contador} intentos ") 

edito:
         después que lo publiqué me di cuenta de la redundancia, la saco:

#-*- coding: utf - 8 -*-
contador = 3
while contador != 0:
    usuario = input("Introduce el usuario:")
    if usuario == "root":
        contraseña = input("Introduce la contraseña:")
        if contraseña == "123":
            print("Bienvenido señor X")
            break
    contador -= 1
    print(f" ERROR \n Quedan: {contador} intentos ")
 

evidentemente no evaluas las posibilidades
1) usuario = root  clave = 356  se queda colgado
2)usuario = jordan clave = 123 se queda colgado
estos son errores de lógica, hay que cambiarlos

además seguis usando variables innecesarias:

loop = True

si te fijas a la variable la usas únicamente para el bucle, y salís con break, para eso directamente:

while True:

esto si bien no es necesario cambiarlo ni es un error es escribir código al vicio.

hay más cosas a mejorar, pero bueno, estás comenzando.

hola:
        ¿lo has probado?, ¿realmente crees que a los usuarios les gusta esperar por qué si?
tiene muchas cosas mal de lógica, otras innecesarias u otras faltan, código reduntante, y errores de ortografía o sintaxis(más vale que podés escribir como quieras, pero está bueno que el resultado final este cuidado). Te recomendaría que busques códigos de esto mismo, hay por toneladas en la red y compares que querés hacer y que hace realmente.Lee más sobre bucles y condicionales como mínimo. Como aprendizaje se nota terriblemente la falta de conocimientos.
No es con intención de ofender ni desmoralizar, práctica más, busca info de manejo de errores y trata de simplificar, en todo caso plantea dudas, hay muchos que saben y mientras no esperes todo hecho ni sea algo que pueda ser malicioso, seguro te ayudarán.
 

después de desciofrar base 64 queda:
".mzjtwu ca uwk wmzzwk zipdum wlpumdumpJ"

esto me llama la atención cor respecto al punto y la última letra en mayúsculas, por lo tanto supuse que hay que reversearla, o sea que empiece por J y termine en "."
por el formato y por que hay repetición de letras pensé en cifrado César y como esta: "kwzzmw", en donde se repite la letra y en españól puede ser rr,ll,ee conté el desplazamiento a esas letras con respecto a z y realice la sustitución. Como dije, nada dificil. 

Machacador:

bueno, igual el autor lo aclaro, pero por las dudas, la mayoría de las cadenas que terminan en "==" significan que están cifradas en base 64, así que ya puede ir por otro paso.

en realidad no parece dificil, salvo que me haya equivocado feo,  dice bienvenido envía correo con tu nombre

Drakaris :
                  bueno, es un error de tipeo, era solo un ejemplo , no iba a poner esa huevada como código, pero después los moderadores piden que usemos código geshi.N siquiera pruebo lo que escribo.
Saludos.

con respecto a que no encontró info, tampoco se esmeró demasiado que digamos
no entiendo esto:

es una manejador de cadenas, se puede usar en cualquier lado que use cadenas

print("ingrese un número: ")
input("\n Número: )
 

también para escribir archivos etc.

hola:
         no puedo explicar con respecto a java porque simplemente no lo uso.
Con respecto al punto 1) depende basicamente de si los métodos son explicitos o no.

el punto 2) das por sentado que todos los perros tienen 4 patas y al ser una variable no declarada en alguna instancia, en este caso el constructor no podrás modificarla.

no has puesto que lenguaje estás usando, ni una línea de código, ahora suponiendo que sea vb.net:

ListBox1.SetSelected(9, True)' donde 9 puede ser reemplazado obviamente por una variable