Puede ser el congedstionar y el rendimiento de descarga - memoria - escrito efectivo en disco.
Yo pienso que ya tube tu misma duda, pienso que llegue a saber que probablemente era por fraca capacidad del hardware para el KDE, tanto en disco, como en rendimiento gráfico, pero aqui a modo texto me da que es eso una mala capacidade de konsole para lidiar con la memoria y escrita en disco con el volumen de paquetes recibidos.
Intenta una cosa simple instalar un otro gestor de consola tipo tilda o algo a ver si pasa lo mismo.