A mi eso me paso y me paso no solo en un pc sino en los dos pues usaba la misma distro en ambos , la ultima release de Comfusion y lo teni en dos pcs distintos con sumamente los mismos programas que uso y me paso en los dos que si queria pasar datos del disco interno a una usb se me hacia muy lento pero cosa muy lenta mismo.
Extrañe que me pasase en uno y probe a ver el otro y tenia el mismo problema , porque habia pensado si en el mi pc de escritorio con cpu no habria enganchado mal algun cable de energia o algo que siempre lo ando limpiando y probé y me pasaba en los dos el mismo problema, me ocurrio justo despues de tener la distro con los updates al dia.
Podria ser algun paquete o programa que estaba en las dos máquinas distintas o bien en el ambiente que fue lo que me quede pensando , pero nunca supe porque me pasaba eso. Despues de cambiar de distro nunca más me paso.
El pc de escritorio si que tenia algunas cosas en disco lo estoy llenando siempre, pero el otro casi no tiene nada.
Cosa extraña, me quede con la idea de que la cosa podria venir de XFCE y thumblerd o algo pero nunca supe dar con la clave.