¿Entonces deberia reinstalar windows no?... pero como podría hacer esta recuperacion de todos los archivos y aplicaciones que tengo en la maquina¿?...

Grax
Aplicaciones instaladas no se recuperan, lo que puedes recuperar son los instaladores de esas aplicaciones si las tienes guardadas... tus documentos, fotos, videos, etc. también los puedes recuperar...
Debes descargar un Linux como por ejemplo Linux Mint, creas un pendrive bootable del Linux con el programa Rufus... metes el pendrive en la maquina, la enciendes y nada mas al aparecer las primeras letras pulsas repetidamente la tecla F11... te aparecerá un cuadro y en el selecciona el pendrive para arrancar con el... se empezara a cargar el SO, seleccionas el idioma y luego no le das a instalar sino a
PROBAR... cuando termine y se abra el escritorio allí podrás buscar el disco donde esta Windows y adentro seleccionar lo que quieres rescatar... el mismo u otro pendrive te servirá para eso...

Saludos.