(suponiendo que la computadora no esta infectada y unicamente el archivo esta infectado y que ademas a la hora de convertir el archivo le borro o cambio absolutamente toda la metadata incluyendo la imagen del álbum).
si no copias la metadata (que es comun en muchos programas) no se pasaría el virus...
incluso si copias la metadata el virus tendría que estar en un campo comun compatible entre ambas metadatas... es decir, la metadata no es siempre la misma ni tiene las mismas caracteristicas y lo que no sea compatible no va...
ojo, ese tipo de virus no es común, ya que tendria que tener 2 partes... el virus infectando la pc y el codigo en el audio, el primero buscaría en los audios este codigo para por ejemplo agregar funcionalidades a su codigo base, como si fueran modulos...y esto requeriría a que el virus sepa exactamente que está esperando en ese audio y donde... (probablemente sería una persona colando un virus a su empresa y haciendo eso para pasar las verificaciones de seguridad)