Mirá, estoy corto de tiempo en este momento para realizar un script, tal vez más tarde pueda meterle un poco de mano, pero se me ocurrió esto:
Cargas de la bd todos los items con id_padre=0. Recorres estos valores cargados uno por uno. Para cada uno, cargas de la bd todos los items con id_padre=id_item_actual (entendes?) y entonces vas guardando los datos en una variable array. --> Recursivo

Una imagen te puede ayudar más: (cuando ya se está en el bucle, se encuentra una subcategoria y se empieza otro bucle, justamente se empieza OTRO bucle, para después completar el/los comenzados anteriormente. Con empezar bulce me refiero a llamar a una función cuando existan items con id_padre=item actual, asi quedaría Recursivo)

Es complicadisimo! No se si el problema es que te enquilombaste mucho! veo que puedo seguir haciendo, sino, me parece que vas a tener que cambiar de método, aunque no lo creo...

Perfecto, agregá otra coluimna en tu base de datos: "njerarquia" siendo:

Así, ID_Padre queda intacto para lo que vos lo utilices, y mi función correría tranquila y correcta

aaaaaaaaa, entonces, id_padre que es? Por qué no me dlo dijiste antes con el ejemplo que te di? 

Que error te da?

//...
'<option value="0">&Iacute;ndice</option>');
while ($valores = mysql_fetch_array($resultados)){
	echo('<option value="'.$valores["ID"].'">'(($valores['ID_padre']>0)?'|'.str_repeat('-',$valores['ID_padre']).'>':NULL)..$valores["Titulo"].'</a><br>');
};
 

Así tendría que funcionar bien, eso creo... jeje.

Yo creo que de esa solucion recursiva que hablas ya se encargo, porque por lo que pienso guarda en la base de datos con un "ID_PADRE" y ya ahi entra en juego la logica con respecto a este id.

entonces quiere decir que:

Si esto es asi, trata de tener una idea segun este codigo:

//$items[] es un array('nombre','id','id_padre')
foreach($items as $item){
	echo (($item['id_padre']>0)?'|'.str_repeat('-',$item['id_padre']).'>':NULL)." {$item['nombre']}";
}

Lógicamente faltan links y tendrias que adaptarlo a TU diseño HTML, que si trabajas con listas, en vez de agregar caracteres ("|-->"), agregar <ul>.

Espero serte de ayuda, si no trabajas de esta forma con los items, o no podes implementarlo, un poco de código no viene mal, aunque esta bien que por ahora no quieras dar código.

PD: Yo también estoy con un proyectito algo asi: "Blotg!" un blog programado unicamente por mi, llevo ya 3 semanas de su comienzo y ya estoy imprimiendo/subiendo/modificando posts,tags,categorias y comentarios. Ya lo vas a ver por aca...

Perfecto!, Agradezco mucho tus respuestas, me estarías solucionando (o por lo menos instruyendo a una posible solución) varios problemas que se nos presentaron. Voy a investigar todo muy bien. Más tarde voy a publicar como me fue con todo esto!

Nosvi!

Exacto, aunque por tablas "por defecto", referite a las que crea si estan utilizando algun CMS compatible con esa base de datos, osea las que crea el archivo "install.php", porque por lo que tengo entendido MySQL 4.x no crea tablas por defecto como si lo es MySQL 5.x ('information_schema')

También podes probar en encontrar ese archivo si es algun CMS, te sería de gran ayuda.

Que tal muchachos, les comento que estoy realizando una web para una escuela, en conjunto con fede_cp y otro integrante más, la cual está basada en Joomla 1.5 (No estamos actualizando a 1.6 por una cuestión del template). Nuestra idea es integrar un sistema en el que los usuarios (Alumnos de distintos años y profesores, estos últimos, los que subirían los archivos) ingresen y puedan descargar contenidos, apuntes, trabajos prácticos, etc. La idea sería que los profesores, se logeen (siempre el logeo para todo usuario sería en joomla, osea la "página principal") y que de ahi puedan subir archivos, documentos ('.doc','.pdf',etc).

Ahora, existe algún plugin para joomla para integrar GDocs? o nos convendría crearlo aparte y crear un link externo en Joomla a ese GDoc, que podria utilizarse porque no un subdominio para mayor comodidad. El problema con esta última opción es que yo pienso que tendrian que crearse dos cuantas paralelas (la del sitio de Joomla, y la de Google). Entonces, Hay forma de relacionar una cuenta con la otra, para que el usuario se maneje más fluido?

Nos vemos!