Si usas una bd MySQL? Sino tenes que hacer lo que te dice Shell, de cargar el contenido en variables, aumentarlas, y volverlas a guardar.

Yo también soy veteran y lo que vos observaste se debe a que hubo cambios de rango en las pruebas, osea una prueba que era de Warrior fue superada por esos users y se quedaron trabados en Veteran, esas pruebas fueron pasadas a Veteran y ellos no reclamaron ser Master como asi lo indica el blog del Warzone.
Y si, necesitas pasar una prueba de Veteran (VidaReal,Hash,este,Doblediversion,Misc_sdc(esta es imposible!!),Crackme_ely y otros mas)

Proba borrando todo (archivos y base de datos) y crearla devuelta.

Ya con esa clase no te puedo ayudar yo
Unplacer ayudarte, nunca dudes en comentar tus problemas que seguramente te vamos a poder ayudar

<?php
include("jpgraph/inc/jpgraph.php");
include("jpgraph/inc/jpgraph_bar.php");
include("conexion.php");
 
conectar();
$result=mysql_query("select * FROM actividades ");
 
$ydata=array();
 
if (mysql_num_rows($result)>0) {
	while ($row=mysql_fetch_array($result)) {
		$queEmp1 = mysql_query("SELECT COUNT(id_actividad)as num,id_actividad FROM asignacion where id_actividad='".$row[0]."'");
		$rowEmp1 = mysql_fetch_assoc($queEmp1);
		$num=$rowEmp1['num'];
 
		//AQUI ES DONDE TENGO EL PROBLEMA CREO YA QUE NADA MAS ME MUESTRA UNA BARRA CUANDO ME deberia DE MOSTRAR 3 YA QUE LA VARIABLE NUM ME ESTA DEVOLVIENDO 3 VALORES OSEA 1,1,1.
		$ydata[]=$num;
	}
}
 
desconectar();
 
$graph = new Graph(750, 350, "auto");    
$graph->SetScale("textlin");
 
$graph->img->SetMargin(40, 20, 20, 40);
$graph->title->Set("GRAFICA DE ACTIVIDADES  ");
$graph->xaxis->title->Set("Altura" );
$graph->yaxis->title->Set("Total" );
 
$barplot =new BarPlot($ydata);
$barplot->SetColor("orange");
 
$graph->Add($barplot);
$graph->Stroke();
 
?>
 

Podrias explicar un poco mejor como están compuestas las tablas? Practicamente que valor o columna está devolviendo $row[0]?
Fijate en el codigo que puse, te saque algunos "conectar()" y "desconectar()" que veia inecesarios, pero, que función realizan dichas?
Además lo que hice fue declarar la variable $ydata como array y en el while se le agrega un nuevo indice con el valor $num. Lo estoy haciendo a ciegas asi que nose si es esto lo que queres. Explicate un poco más.

Saludo!

Te hice una función:

function fileLine ($flotaFile, $flotaContent, $flotaLine) {
	$file=file_get_contents($flotaFile);
	$file=explode("\r\n",$file);
	if(array_key_exists($flotaLine-1,$file)) {
		$file[$flotaLine-1]=$flotaContent;
	}else{
		die('El número de línea ingresada no existe.');
	}
	return(file_put_contents($flotaFile,implode("\n",$file)))?true:false;
}
$content='echo $p."Modifico la linea"; //esta linea fue modificada';
if(fileLine('ini.php',$content,2)){
echo "ok";
}else{
echo "no";
}

Cualquier error o pregunta que tengas, no dudes en comentar...

Al igual tiempo de expiracion seteado en la cookie, tiempo de expiracion de sesion en la base de datos. Osea, otra columna más que sea expire con la fecha y hora en que expira la sesión. Entonces, si loged es true pero ya expiró, tomá a loged como false y listo.

Agregá una columna a la base de datos, puede ser "loged", entonces, al momento en el que usuario inicia la sesión, vos cambias ese valor por "true" o "1", y cuando cierra la sesión lo volves a "false" o "0".
Entonces, cuando intente iniciar sesión en otra ubicación (por ende, si intenta iniciar la sesión, no tiene cookie) y ya está logeado en otro lugar, comprobas el valor de "loged", si es true, retornas error, si es false, lo logeas comúnmente.

Saludos..

$rutafoto= "fotos/".mt_rand(1000,9000).$_FILES['file']['name'];
if (is_uploaded_file($_FILES['file']['tmp_name'])) {
	if (move_uploaded_file($_FILES['file']['tmp_name'],$rutafoto)) {
		echo "El tamaño del archivo a subir es: ".$_FILES['file']['size'];
		echo "<br />La ruta del fichero origen es: ".$_FILES['file']['tmp_name']."<br />";
		echo "<br />La ruta del fichero de destino es: ".$rutafoto."<br />";
		echo "<br />El archivo se ha movido correctamente <br />";
	} else {
		echo "<br />El archivo no se ha movido";
	}
}

No se si el codigo que nos mostraste es identico al que usas, porque está llendo de errores de sintáxis.
Probá ese código que te di que guarda el archivo siempre en uno nuevo, tal vez así no da problemas. Sino, intenta con

copy();

pero move_uploaded_file no tendría que causar ningún tipo de problemas.
Podrías pegar exactamente lo que imprime TÚ script?
Saludos

Predón, pense que utilizaba isset (mala custumbre mia la de usar isset) esta perfecto lo que dijo Yoya, asi como tambien en su blog recomienda usar empty. Disculpen...