a mi lo que se me ocurre para poder transformarlo es que el stub lea e incorpore en una variable el bat y luego cree un archivo y lo ejecute (y alli segun el modo: visible o invisible).
yo prefiero Vb 6.0 xq es mas portable, el net necesita de frameworks (si programas para tu uso, algo como para robar info, pues el net no te serviria mucho). pero en cosas empresariales, creo que el net es mas util. tambien depende de cada persona.