Si te refieres al número del tipo SOCKET, es un identificador. Los datos los guarda el SO.

Si no sabes qué problemas tienes, ¿cómo sabes que tienes problemas?

Di qué error tienes, qué no ocurre correctamente, o qué no sabes implementar.

Ese numero1=numero hace que numero y numero1 sean iguales, así que el programa no funcionará. Pon esa igualación al final del bucle.

Dentro del if, puedes poner un break; para salir del bucle cuando hayas encontrado los números.

Una opción, es medir el tamaño de cada cadena anterior, y poner un número de espacios conveniente.
por ejemplo, si quiero poner 1 nombre, y 1 número a los 10 caracteres, pondría:

Y así, hacer los cálculos.

Saca por consola el tamaño del array tokens.

miCoordinador es un campo de la clase VentanaExplotaciones. El primer momento en que se inicializa es en el constructor. En ese constructor, no lo inicializas.

Saca por consola los valores de miLista y de miCoordinador, y comprueba qué son.

Las lineas no existen tal cual. Las líneas son solo formas de interpretar los caracteres '\n'. Por esa razón, tienes 2 opciones: o crear un índice de líneas en el fichero para un acceso inmediato a ellas, o ir contando saltos de linea (que supongo que es lo que haces ahora)

Ahora el que no inicializas es miCoordinador :/

Ten algo muy claro: Los objetos en Java hay que inicializarlos para usarlos, <todos>, salvo los tipos básicos. Pero todos los demás objetos los inicializas de la forma conveniente, ya sea con new, o con otras técnicas, como String str = "Abc";.

Si ya sabes C++, no tendrás problema con leerte la referencia delibrerías, clases y funciones: http://www.cplusplus.com/reference/

Además de todos los otros contenidos que tienes en esa página, como: http://www.cplusplus.com/articles/

No puedes utilizar métodos sobre un objeto null.
Pusiste miConexion = new Conexion(). Tuenes que hacer lo mismo con List.