Seria lo mas logico, que re-escribas tu codigo. Tenes en cuenta que al momento de instanciar un objeto, se carga en memoria todo el codigo correspondiente a su clase. Y por otro lado si tenes una clase con unos 100 metodos, pero en determinados momentos solo usas un par de ellos, eso quiere decir que no estas usando bien el paradigma POO
Otra cosa que podes hacer es hacer tu code mas flexible usando include, asi podes incluir ciertos metodos solo cuando son necesarios, es lo que yo hago. Por ejemplo si estas en un punto en elque solo vas a actualizar la BBDD de personaje, solo usa las funiones miembros para eso. Pero lo mas recomendable es que te replanties las clases y su implementacion
Saludos