Para borrar los directorios tendrás que poner un par de líneas con el comando RMDIR, documentado a continuación:
RMDIR [/S] [/Q] [unidad:]ruta
RD [/S] [/Q] [unidad:]ruta
/S Quita todos los directorios y archivos del directorio además
del mismo directorio. Se usa principalmente cuando se
desea quitar un árbol.
/Q Modo silencioso, no pide confirmación para quitar un árbol
de directorio con /S
Si lo que quieres borrar es solo los archivos, el comando que necesitas es Delete:
DEL [/P] [/F] [/S] [/Q] [/A[[:]atributos]] nombres
ERASE [/P] [/F] [/S] [/Q] [/A[[:]atributos]] nombres
nombres Especifica una lista de uno o más archivos o directorios.
Se puede usar comodines para eliminar varios archivos.
Si se especifica un directorio, todos sus archivos se
eliminarán.
/P Pide confirmación antes de eliminar cada archivo.
/F Fuerza la eliminación de archivos de sólo lectura.
/S Elimina archivos especificados de todos los subdirectorios.
/Q Modo silencioso. No pide confirmación sobre eliminación con
comodín global
/A Selecciona los archivos que se van a eliminar basándose en los
atributos
atributos R Archivos de sólo lectura S Archivos de sistema
H Archivos ocultos A Archivos preparados para
almacenamiento
I No archivos indizados de contenido L Puntos de análisis
- Prefijo de exclusión
Las rutas a las que apuntas tienen variables de entorno de Windows que puedes utilizar para esto y así valer para todos los users. En el caso de Roaming es %appdata%
Por tanto, lo siguiente te valdría:
%appdata%\Thunderbird\Profiles\ohyg5cbz.default\global-messages-db.sqlite
%appdata%\Thunderbird\Profiles\ohyg5cbz.default\global-messages-db.sqlite-journal
Estas rutas apuntarían a la carpeta "Roaming" del usuario en el que corras el .bat
Un Saludo