Prueba a quitar el filtro del bssid y usalo asi: airodump-ng --channel x(donde x es el canal en el que está el ap a auditar) -w archivo mon2. Luego cuando uses aircrack-ng para buscar la clave elige la red (bssid) que quieres y listo.
Podrías explicarte un poco mejor... Se escucha el sonido del pen cuando exactamente? has mirado en la configuración y temas de sonido de windows? Pasale un antivirus actualizado y un antispyware a ser posible desde el modo a prueba de fallos o mejor aún utiliza algún liveCD con linux y pasale antivirus y software de limpieza.