Puede ser que el windows que instalas en el pendrive también esté en mal estado. Prueba con otra .iso y para conectarlo a otro pc pues sácalo del tuyo y lo conectas al otro xD
Si el fallo es de hardware si instalas linux a lo mejor el fallo no se llama igual pero algo también te irá mal..si el problema es de software prueba a instalar linux y a lo mejor te llevas una grata sorpresa