La verdad, entendí poco y nada....
Tienes un EXE que tiene 3 funciones... (de uso no condiciones????) y eso que es??
Son funciones exportadas por el EXE?? O son internas??
Quieres modificar el EXE para que una de esas funciones se ejecute cada 6 minutos??
No te entiendo... quizás si lo explicaras mejor...