Mira este tutorial para orientarte un poco de lo que hablan.

Creación y uso de plantillas o templates en PHP
http://www.cristalab.com/tutoriales/creacion-y-uso-de-plantillas-o-templates-en-php-c132l/

Codeigniter(framework), como te recomendaron posee una classe para crear templates.

Template Parser Class
http://ellislab.com/codeigniter/user-guide/libraries/parser.html

HTML, paginas estáticas.
PHP, paginas dinámicas.

No hay mas ciencia.   

Seguro te habilitan la cuenta si hablas con ellos y no lo vuelvas a hacer  , si queres pasar a un hosting pago no tendrias que empezar de nuevo, backup, redirección a tu nueva url y listo.

A simple vista, no y viendo html, css, js rapidito tampoco., seguro la desarrollaron ellos.

Querés ponerle un fondo al submenu? creas otro div, que esté centrado, tenga de ancho 1024px y hay utilizas la propiedad css background(y dentro de este está tu submenu, si estas en firefox apreta shift+ctrl+i y verás que lo hicieron de la misma forma).

Tambien se puede hacer con solo 1 div y con una imagen de 1024px de ancho haciendola centrar en la medio sin que se repita.

body { 
  background-image: url("imagen-1024px-ancho.jpg");
  background-position: top;
  background-repeat: no-repeat;
}
 

Te faltan comillas dobles ( " ), donde será ? 

<tr id='cel' <?php if($valor['Bandera'] == 1) echo "<script lenguaje=javascript>window.parpadeo='true';</script>";?></tr></a>

El background es negro y blanco o te referis a la imagen?

Podes hacerlo con css(se utiliza un color o una imagen si quieres).
http://www.mclibre.org/consultar/amaya/css/css_fondos.html

Podes aprender html y css aca, no es necesario utilizar programas como dreamweaver, frontpage, etc.,(agrega codigo inecesario) podes hacer un sitio web con el editor de  texto de windows si queres, pero te recomiendo que descarges sublime text.

Dice que la variable $tipo no esta definida.

$tipo=$sep; 
$sep=explode('image/', $_FILES[ 'file' ]['tmp_name'], $destino . separador . $cad. '.' . $tipo);
 

Cambia la configuración de Skype, entrá a la parte de opciones y desactivá la opcion de "utilizar el puerto 80, 445", creo que era.