hola,
no es nada dificil, en la imagen que te puse salen los ejemplos con cada aplicación, ló único que tienes que hacer es cambiar el titulo de la ventana por el del programa que quieres ejecutar.
No puedes ejecutar un programa oculto a menos que lo hagas desde la consola, ya sea con un archivo Bat, o con un VBS, sobre VBS puedes encontrar ejemplos en el buscador del foro, y con batch también.
en un acceso directo ("programa.lnk") lo puedes agregar al menú "inicio" donde ejecutas los programa al inicio de sesión, y poner:
CMD /C "Start /B "programa.ese" & Nircmd win hide ititle "programa""
EDITO: ups, puse "
and" en vez de "
&", cosas de la resaca xD, ya lo he corregido.
Y listo.
un slaudo