¿pero buscas un analizador de tráfico web o un analizador de errores?
Yo uso Awstats en ns2.elhacker.net, para los errores pues mod_security te reporta los errores de seguridad (según las reglas definidas) o mirando el error_log del apache te dirá todos los errores 404, etc.
ossim o splunk recomendaron recientemente en la lista de correo de la rooted.