quiero meter las distintas líneas de un documento en variables para después trabajar con ellas
sí claro, y cuál es la duda, en principio cada línea es un identificador separado por fin de línea hasta el fin del documento.
Un modo muy sencillo es cambiar la entrada y salida estandar de la shell a un archivo y tratarlo como si fuese la terminal. La salida que esperabas ver en la pantalla irá a parar al archivo.
para leer si no quieres profundizar sobre read, sed y awk son tus amigos.

