Configurando el Kasper para chequear todos los archivos y todos los puertos puede ralentizarse bastante...
De llave de lista negra a llave sin problemas uno activa la demo de 30 días...

Si has formateado y sigues con las mismas... yo ensamblaría el PC de nuevo habiendo quitado todo el polvillo, cambiando la pila de la placa base y asíéndole un low level format al HDD (parece que me ha dao por ésto últimamente

, pero la verdad es que quitas todos los rootkits (y otros malwares) y dejas el HDD como nuevo, aparte de pasarle el scan que suele venir en la aplicación y saber su estado).
Los ralentizamientos son de dos tipos: por HDD (no está en estado óptimo) y procesador (no está bien refrigerado).
Un saludo.
P.D.: la RAM en mal estado sólo dá el coñazo.