A mi me va perfecto.

Bueno, en priemr lugar, es eno es mi código -.-'
En segundo lugar, a mi me da resultados correctos.

Okay, acabo de abrirlo de la forma:

fstream a("asd.dat", ios::binary);

Y ya me fue :p

EDITO: No me fue. Me va solo si el fichero no está creado. Si está creado y vacío, no me va D:

EDITO2: Fallo de mi algoritmo jiji

Hola, tengo un problemilla.

fstream a("asd.dat");
a << "hola";

En general, es eso. El problema es que si el archivos está vacío, no escribe nada.

¿Sabéis algo al respecto?

Modificando lo que dije al principio:

int binario(int num){
    int temp=0;
    for(int i=0; num>0; i++){
        temp+=(num%2) * pow(10, i);
        num/=2;
    }
    return temp;
}

Cambiando la función de void a int, haciendo que retorne "temp", y cambiando num/=10; por "num/=2;". Eso fue un fallo mio.

Como dato curioso, dejé el programa 20 segundos, y me generó 1 giga de txt. Sin querer, abrí el txt, y así fue como se me paró el ordenador 1 minuto jaja

Te diría que la guardes en un array de char. Si realmente quieres guardarlo en un int, haz:

void binario(int num){
    int temp=0;
    for(int i=0; num>0; i++){
        temp+=(num%2) * pow(10, i);
        num/=10;
    }
}

Creo qeu así debería ir. No lo probé, eso te lo dej a ti :p

 for(i= 1 ; i==1 ; i++)

Ahí estás diciendo que solo se haga el ciclo mientras i sea == a 1. Cuando el avlor de i cambie, el ciclo no se volverá a repetir.

void intercambio(int mitad, int vectorUno, int vectorDos);

Esa es la declaración.

void intercambio(int mitad, int vectorUno[mitad], int vectorDos[mitad])

Y aquí la pones, diferente. No pusiste los corchetes, que implica que es un puntero.