Si quieres reemplazar el elemento completo, tienes replaceWith.
Si solo quisieras cambiar la clase, tienes removeClass y addClass.

Sin ir más lejos, lo evidente:

		Graphics2D g2=(Graphics2D) g;
		g2.setColor(new Color(r.nextInt(255),r.nextInt(255),r.nextInt(255)));
		Ellipse2D circulo=new Ellipse2D.Float(x-radio, y-radio, radio*2, radio*2);
		g2.fill(circulo);

Estás pintando 1 círculo.

Si quieres pintar 2 cídruclos, tendrás que ponerlo.
Si quieres pintar indefinidos círculos, tendrás que hacerlo con ciclos, como for.

Lo primero: ¿Trabajaste alguna vez con ArrayList, LinkedList, List o arrays? Si la respuesta es no, es lo primero, antes de mezclarlo con los gráficos.
Si ya has trabajado con alguno, entoncces la dinámica es: En el evento de click, almacenar un nuevo punto (x,y) en el array/lista. En paint(), recorrer la lista y dibujarlos todos.
Son 2 pasos bien diferenciados, obtener datos y utilizar esos datos. Empieza por ahí.

Acerca de almacenar los puntos, puedes crear una clase "Punto{ int x; inty; }".

No definiste la función Agregar(). Solo la declaraste.

En javascript las variables no se copian. Tampoco se pasan por referencia. Es como pasar una referencia al objeto que contiene. Con lo cual, los objetos grandes no tendrán problema.

Y bueno. Lo de que un módulo de Node tenga acceso a una variable de otro código que va a importar ese módulo... Es casi una referencia circular, que es mejor evitar.

Pues o jframe.add(jpanel) o jframe.getContentPane().add(jpanel).
Si no, tendrás que dar más datos.

El modulo "b.js" no debería depender de una variable de otro archivo salvo que lo importe.

La mejor opción, es pasar el valor a mano. Puedes exportar en "b.js" una función "setVar()", y llamarla desde "a.js". Solo la llamarías una vez, es la ventaja, no tendrías que pasársela a cada función.

tolower no convierte arrays, convierte solo 1 char: http://www.cplusplus.com/reference/cctype/tolower/

Y en cualquier caso, no puedes poner un array en un switch.

Sí a todo

En C#, salvo los tipos primitivos, el resto funciona como si fueran punteros de C++.

Un array inicializa sus valores a valores por defecto. El valor por defecto de una clase es null, en el caso de primitivos, 0 o false en caso de boolean.

¿Qué es "srt"?
En cualquier caso, cuando pongas errores, di en qué líneas se encuentran.

No hay una forma de hacerlo así en 1 línea.
Realmente, no es necesario a la hora de hacer estos programas.

Ahora bien, tienes la opción de crear una función tipo "create<Producto>(entrada)", que lea la línea, acceda al constructor de la clase por reflection y trate de inferir los argumentos a partir de los constructores de la clase y de la línea leída.

Esto no es tan sencillo, así que mi recomendación es que lo evites. No es necesario complicar tanto un programa.