Bueno... lo que pasa es que el programa que usaste te elimino las particiones y formateó el disco completo... hasta allí no veo ningún problema, instala tu Sistema Operativo y luego has las particiones que quieras con el programa que prefieras (yo uso el "EASEUS Partition Master")

Si lo que quieres es recuperar lo que tenias en esas particiones, puedes usar algún programa especializado para eso (yo uso el "RECUBA")... si quieres recuperar la información sin instalar ningún Sistema Operativo, puedes usar la LIVE de "Hiren's Boot" que trae varias herramientas incluyendo el Recuba...

Suerte.