Hola, bernyx123; a decir verdad, creo que la respuesta es si, aunque, bueno, tampoco se exactamente hasta que punto puedes hacer que un programa haga todas las acciones que quieras; por ejemplo, lo que comentas del utorrent, creo que no es posible (aunque no estoy muy seguro y/o no se como hacerlo en caso de que, bueno, se pueda hacer); no obstante, y, en cuanto a lo que comentas de las carpetas, y, sabiendo ciertos programas que he visto, si, creo que si es posible hacerlo, pero bueno, y, lo que me vengo a referir es que, bueno, si, es posible que un programa haga una serie de "ordenes y/o acciones" previamente programadas por si solo y sin que tu veas nada relacionado con lo que esta haciendo, aunque, claro, estoy completamente seguro (o, almenos, casi seguro), que, bueno, siempre hay y/o puede haber un limite para todo (tanto en esta duda que comentas como para todo), aunque, bueno, todo depende en como hagas el programa y demas podras hacer unas determinadas cosas y/o otras (por decirlo de alguna manera).
Y, bueno, por ultimo, espero haberte podido ayudar en cuanto a la duda que has comentado en este tema, y, bueno, muchas gracias por vuestra atencion.
Saludos.

Muchas gracias por vuestras respuestas.

Frankener, crees que podria hacer las dos cosas que digo? Que deberia de aprender y utilizar para hacer eso?

WoW!! Estoy viendo un tutorial del Autoit. Veo que es muy basico (por como lo dice el del video) pero empezare por alli

Tengo la duda de si podre hacer que el programa se adapte a los demas programas para que los pueda controlar... Al principio pensaba en hacer que le de clic a X coordenadas, pero tiene que ser demasiado exacto.
Espero que este programa tambien toque DLL tal hi como dice Frankener (aunque nunca he tocado ninguna).

Muchas gracias por las dudas.

Gracias probare a ver ^^ ya os dire más adelante que tal me va jajaja.

Saludos