Eduardo97 los ifs no se terminan con ";" porque no es una instrucción es un bloque de código (solo va con "{" y "}").
y cuando haces:

if ((%s,opt) == "gen")
 

"(%s,opt)" no se a qué te referias, pero no se puede ese tipo de cosas. El %s es un parametro de scanf donde le indicas que lea del teclado una cadena y no cualquier otra cosa.
En todo caso si quieres preguntar si la cadena opt == la cadena "gen" no puedes, porque las cadenas de texto no se pueden igualar así como así. Utiliza strcmp que justamente realiza eso, compara cadenas de texto. Asi (incluyendo string.h):

if ((strcmp(opt,"gen") == 0) {
    goto gen;
}
....
 

Tambien, en esta parte

...
goto exit;
return(0);
...
 

nunca se va ejecutar return(0), porque salta directamente a exit. Igual, para ver como son está bien, pero no es muy buena practica usar gotos ni tampoco system. Pero no hay problema si estás empezando. Te dejo el codigo completo arreglado:

#include <string.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
 
int main(void){  
char opt[10];
 
  printf ("\n");
  printf ("Mi programa>");
  scanf ("%s",opt);
  fflush(stdin);
 
  if ((strcmp(opt,"gen"))==0)
  {
      goto gen; 
  }
  else 
  {
       printf("Comando invalido");
  }		
 
  exit:
    system("cls");
    printf("\n");
    printf("Adios");
    system("pause > null");
    return 0;
 
  gen:
   system("cls");
    printf("\n");
    printf("As elegido la opcion Gen");
    goto exit;
 
}
 

Te lo corregí un poco.
Espero haberte ayudado.

Jeje, lo siento, se me pasó por alto, ahora lo edito.