Hola Mimolo, mira yo nunca probe el Nircmd en Vista, pero creo que tu problema se debe a que no tienes los suficientes privilegios para hacer la edicion del registro.
Y otra es que tu Antivirus esta detectando a Nircmd como aplicacion potencialmente no deseada, dado el poder que tiene Nircmd.
Panda Scanner Online
Incidencia: Herramienta potencialmente no deseada:Application/NirCmd.A
Estado: No desinfectado
Elemento : C:\WINDOWS\nircmd.exeAsi que prueba desactivando tu AV y prueba asi, y tambien consulta como tener privilegios sobre el registro.
O si no prueba con REG ADD, para añadir un valor en RUN.
REG ADD :
REG ADD HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run /v TUBAT /t REG_SZ /d "c:\Mibat.bat"
No se como sera el comando REG en Vista, pero me imagino que ha de ser muy similar o igual.
Saludos.