yo tambien creo que es preferible escribirlo en lenguaje que en pseudo por otro lado creo que algoritmia seria programacion general

ok, te explico, no es necesario (y dudo que en general sea de alguna manera practico) volcar todo un pc como servidor para tu fin, con wamp tu eres un servidor web completo...

1- la diferencia es quien lo controla... el que tiene más potencia normalmente es el de la empresa (y depende del plan adquirido) porque posiblemente sea un i7, 8gb ram pegado a una red de 100mb/s

2- en la red no hay nada flotando realmente todo está en computadoras regadas por el mundo, el wampp está instalado en tu computadora y configurado bien permite que los usuarios accesen a ti sin notar diferencias con cualquier lugar de la red "normal"

3- no necesitas avisarselo a godaddy, pero puedes que usarlo de intermedio para que tus correos se envien por medio de el y se usen sus protocolos para el envio, si quieres que la pagina en tu pc sea la contratada en godaddy, si, tienes que configurarla para indicarle la ip de tu pc (pendiente con las ip dinamicas)

4- creo que aun no tienes mucha claridad sobre lo que es un servidor web... explicacion rapida... es todo aquel que puede desde internet ser conectado por medio de los protocolos comunes (http, https, entre otros) para ver paginas web o descargar archivos, los servidores como tal son programas instalados en una computadora, para ti (y para godaddy con el plan normal) el servidor es un "apache" (así se llama el programa) que corre sobre el sistema operativo(para ti linux, para ellos probablemente ubuntu o cualquier otro), el apache tiene capacidad de manejar php y otras funciones... listo, en resumen godaddy para tu pagina tiene una pc puesta, con linux (por cosas practicas y económicas) con un programa llamado apache instalado y listo...
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con respecto al servidor web
1- si, podría, tomar tiempo, el tiempo va dado más que todo por la potencia de tu pc y tu velocidad de conexion (100.000 correos sería comparable a subir a internet un archivo de varios GB)

2- como supongo que dejamos este asunto ya atrás, pondré la comparacion entre godaddy y tu pc... es más rapido desde el servidor de godaddy, debido a su ancho de banda

3- con un sistema bien hecho, lo que haces es que en un base de datos por ejemplo colocas el campo "email" y "enviado", antes de enviar colocas "enviado" a 0 (manejando base de datos, que normalmente ya son muy eficientes, colocar 100.000 campos a 0 no tardará más de 5 segundos), cada vez que envíes el correo, lo pasas a 1, en caso de fallar, solo tienes que decirle al programa que busque al ultimo y retome desde ahí...  el programa que usabas en windows usaba capacidades web, ya vez más o menos como es...el asunto es que al ser tantas direcciones, no se espera que un programa simple lo haga...

no te preocupes! XD para el css eso es casi nivel medio! XD

cada zombie se conecta con el siguiente, es una gran cadena pasando un mensaje de mano a mano... no te voy a explicar como se programa, primero porque no es mi campo, segundo porque los temas ilegales o no éticos, van contra las reglas del foro

exacto! una botnet... no necesariamente se esparcen por web, más que todo por pendrive (según estadísticas), para conseguir el "anonimato" atraviesas una red de 10 nodos y quien te quiera cazar, tiene que hackear 10 computadoras hasta ti, la teoría es simple...

si, los bots se programan, el lenguaje, básicamente cualquiera... desde scripts tipo vbs, hasta hechos en c

si... para eso son los "bots" algunos programas virales son para usar al sujeto como intermedio en una conexion, estos programas se dispersan por las vias regulares de infeccion

olvidate de los proxys...

quedemosnos con los vpn... tor es un vpn no proxy...

1-no, normalmente usan como vpn una computadora infectada (un nodo zombie) y se conectan por medio de ella o hacen encadenamiento entre varios pc zombies, con un vpn de pago, si la policia quere los datos y estan en EEUU, están obligados a entregarlos... en su defecto usan tor...


2- si quieres anonimato, solo por seguridad, y tal vez para despistar de vez en cuando a la nsa tor + tortilla  o tor con algún otro añadido, son hechos para mejorar la seguridad de tor...

3- sería encadenamiento de vpn, y realmente no se que programa puedas usar (a demás de maquinas virtuales)

te explico un poco los vpn, ssh y proxy...


un vpn es una conexion cifrada entre 2 computadoras, normalmente el servidor el el "nodo de salida" y el cliente es quien se conecta

cuando un cliente se conecta a un servidor se "abre un tunel cifrado" en internet para que sus datos viajen, es decir, tus paquetes (por ejemplo http) son cifrados (ilegibles a menos de tener una contraseña) viajan por internet al ip del servidor, descifrados por el servidor y enviados de nuevo por internet hasta su destino...

cliente- (tunel vpn--------------fin del tunel) - servidor - internet
             lan del cliente - isp del cliente

desde tu pc, hasta el servidor nadie sabe que contienen los paquetes (más cualquiera puede saber a donde van), el servidor conoce exactamente tus paquetes (hasta donde es legible, ya que https es una capa de cifrado similar) y todos entre el servidor vpn y el servidor http saben el contenido (sigo con la excepcion https) eso es todo lo que puedes hacer con el vpn...

cuando el servidor https y todos los que puedan ven el paquete del vpn, tiene como origen la ip del vpn, no la tuya, ahí viene la parte anonima

luego están los proxys, es similar a un vpn solo que no cifran... ellos reciben tus paquetes, los leen y reenvian, igual que el vpn la ip de salida es la del proxy... los proxys tienen como uso real otras cosas, como filtros, especialmente a nivel empresarial, para evitar que se entren a ciertas paginas

por ultimo (y si, menos importante) ssh, ssh es consola de comandos como el cmd de windows, pero en un cifrado similar al https


ahora con tus preguntas...

1- si, puedes crear un servidor, pero la ip de salida será la de tu servidor... esto es util (para mi) para moviles y tablets, creas el server en tu pc, conectas el movil al vpn siempre que entres en wifi y aunque sea un wifi "no seguro" tus datos estarán protegidos por el tunel vpn
2- teoricamente se diferencian en la velocidad y en que como no tienes un contrato con los gratuitos, podrían vender la informacion con fines de marketing, analisis, etc...
3- si puedes, son 2 capas diferente (leer protocolo tcp ip para entender las capas) tendrías una sesion de consola con otra pc que tiene la seguridad del vpn + que el vpn no podria leer el contenido tampoco
4- si, si puedes por el asunto de las capas

con los proxys
1- si se puede, no cambia tu ip, solo te enmascaras con el... tu ip, se verá como la de el... esto aplica tambien para vpn
2- no lo se...
3- si, puedes hacer "encadenamiento de proxys" para que sea más dificil conseguirte de vuelta... igual si haces algo peligroso tardarán como 10 segundos en dar contigo por ese metodo XD
4- basicamente las tecnicas son esas... más efectivo que  vpn+https es no conectarse a internet XD

explico un poco de tor para terminar

tor aplica la tecnica vpn, pero el toma 3 nodos aleatorios, es decir, hace "encadenamiento de vpns"

pc-------nodo1--------nodo2------nodo3------intenet
tunel-----------------------------------|
tunel-------|--------------|------------|

al ser nodos desconocidos entre ellos, anonimos como tal, como el camino es aleatorio y miles de pcs tienen caminos diferentes, es muy dificil rastrear de vuelta. aunque hay tecnicas (la mayor parte de ellas involucra jscript, java o flash) que no te rastrean de vuelta, sino tratan de sacarte algun identificador del pc que puedan reconocer luego si te conectas sin tor y cosas así

con html solo realmente no haría un nivel "alto" notable especialmente haciendo uso completo del css (y sin js), lo más alto, serian los "meta"

por otro lado en jscript al si ser un lenguaje de programacion (y haciendo uso del html+css como su parte visual) lo más alto dependería de la rama, por ejemplo, podrías aplicar encriptacion asimentrica sin https a nivel de cliente-servidor o cliente-cliente, podrías hacer un "photoshop" haciendo uso del canvas, etc

por que todos llegan preguntando por "el mejor", para todo lo que pides no sería "el mas adaptable", "el mas practico" o en si defecto "el mas seguro"? (que lo mas probable es que no este ni cerca de caer en las 2 clasificacioned anteriores) que probablemente el mas seguro ni la nsa pueda con el (por lo menos no antes.del interrogatorio)