RD /Q "%Windir%\System32\Test"

Me puedes explicar porque no se puedo de la manera que yo lo hice. 

Luego de explicar podes dar por solucionado.

!windir!
!appdata!
!homedrive!
etc...

@Echo OFF
setlocal enabledelayedexpansion
For /F "Tokens=*" %%# in (archivo.txt) do (echo %%#)
Pause
Exit

Clock 08:15:00 Echo+ Buenos dias!

Clock 22:50:00 Shutdown /R

@Echo OFF
Clock 14:30:00 
Echo Ha llegado la hora de comer!
Pause
Exit

:::::::::::::::::::::
::: CLOCK UTILITY :::
:::::::::::::::::::::
::: By El_Ianna
::: Mod by Elektro H@cker
 
@ECHO OFF
 
REM Comprobación de errores.
IF "%~1" EQU "/?" (GOTO :HELP)
IF "%*" EQU "" (GOTO :MSG)
 
REM Seteo de la hora seleccionada.
SET "FINAL=%1"
SET "FINAL=%FINAL::=%"
IF "%FINAL:~0,1%" EQU "0" (Set FINAL=%FINAL:~1%)
 
REM Seteo de la acción.
SET "ACTION=%*"
SET "ACTION=%Action:~8%"
 
:SLEEP
SET "HORARIO=%TIME:~0,2%%TIME:~3,2%%TIME:~6,2%"
SET "HORARIO=%Horario: =%"
IF %HORARIO% GEQ %FINAL% (GOTO :END) ELSE (GOTO :SLEEP)
 
:HELP
ECHO+
ECHO: MM'""""'YMM M""MMMMMMMM MMP"""""YMM MM'""""'YMM M""MMMMM""M 
ECHO: M' .mmm. `M M  MMMMMMMM M' .mmm. `M M' .mmm. `M M  MMMM' .M 
ECHO: M  MMMMMooM M  MMMMMMMM M  MMMMM  M M  MMMMMooM M       .MM 
ECHO: M  MMMMMMMM M  MMMMMMMM M  MMMMM  M M  MMMMMMMM M  MMMb. YM 
ECHO: M. `MMM' .M M  MMMMMMMM M. `MMM' .M M. `MMM' .M M  MMMMb  M 
ECHO: MM.     .dM M         M MMb     dMM MM.     .dM M  MMMMM  M 
ECHO: MMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMM MMMMMMMMMMM | MORE & REM "
ECHO: Suspende el proceso de un programa por lotes hasta la hora determinada. | MORE
ECHO: ¯ CLOCK [HORA:MINUTO:SEGUNDO] | MORE
ECHO: Ejemplos: | MORE
ECHO: ¯ CLOCK 20:30:15
ECHO: ¯ CLOCK 22:50:00 Shutdown /R | MORE
ECHO: La hora se aplica con un formato de 24 horas. | MORE
ECHO: (Codeado por Ianna. Modificado por Elektro H@cker.) | MORE
EXit /B 0
 
:MSG
ECHO msgbox "La sintaxis del comando no es correcta. CLOCK /? para mas informacion.",16,"Utilidad Clock (By Ianna)" > "%TEMP%\Clock.vbs"
START /B Wscript "%TEMP%\Clock.vbs"
Exit /B 1
 
:END
ECHO+
ECHO: Utilidad Clock (By Ianna) | MORE
IF Defined ACTION %Action%

REM Comando que requiera privilegios de Admin para "probar" los privilegios + el resto de comandos:
Mkdir "%Windir%\System32\Test" && comando1 & comando2 &...

@Echo OFF
 
NET User "%username%" | find "Admin" >NUL
IF NOT %ErrorLevel% EQU 0 (
     ECHO: msgbox "No tiene privilegios de Administrador.",16,"ALERTA" > "%TEMP%\Msgbox.vbs"
     Start /B Wscript "%TEMP%\Msgbox.vbs"
     Exit /B 1
)
 
REM El resto de tu script aquí...
Pause
Exit