No se decirte si puede ser compatibilidad con el cable, el puerto frontal, el movil o el hecho de no este directamente conectado el frontal con la placa base. No entiendo demasiado el fallo y porque, esto es tan complejo...
El tema es raro, porque todos los usb en los frontales, de almacenamiento, tipo pendrive y otros, si funcionan bien y no he tenido ni un problema. Seria raro si fuera del puerto en si, no funcionaria con otros espacios.
Fíjate si los de atrás son azules. Puede ser que los frontales son USB 1.0 (blancos) y los de atrás sean USB 2.0 (azules). Cuando conectas una memoria flash, la PC lee los sectores, cuando es un móvil, el android los envia y para esto requiere 2.0. O al menos es se me ocurre.