"SQLite error no such table: CMB_USUARIO" acabo de probar las fuentes que me mandaste y eh llegado a la conclusión que sencillamente la base de datos no se copia al emulador o en tu caso al dispositivo. Para ello use "File.Exists("CLAS_MOBILE.db")" y siempre me decia que no existe la base de datos
- If (File- . Exists("CLAS_MOBILE.db")) Then
 
-         consulta = String.Format("SELECT USU_USUARIO,USU_ZONA FROM CMB_USUARIO WHERE USU_USUARIO='{0}'", USUARIO.Text) 
-   
-         Dim Ada As New SQLiteDataAdapter() 
-         Dim Sqlstr As New SQLiteCommand(consulta, cnn) 
-         Dim dr As SQLiteDataReader = Sqlstr.ExecuteReader(CommandBehavior.CloseConnection) 
-         While dr.Read 
-              Dim value As Object = dr.Item("USU_ZONA") 
-              If value IsNot DBNull.Value Then TextBox1.Text = CStr(value) 
-         End While 
-         dr.Close() 
- Else 
-         MessageBox.Show("No existe base de datos", "Error") 
- End If 
Solución:1° Método que no entendí porque me dio flojera :visita 
http://social.msdn.microsoft.com/Forums/es/netfxcompactes/thread/265e4adb-ba0c-440a-808a-f63590ada195 y has lo que hay dicen para poder copiar archivos(tu base de datos entre otras cosas) al emulador o copia directamente al dispositivo en el que estás trabajando  y si es posible explícame.
2° Método que yo haría si fuera el caso:Pues consiste en crear la base de datos con código, para ello has de tomar en cuenta que si al "SQLiteConnection" le enviamos como parámetro "Data Source=CLAS_MOBILE.db"  y ejecutamos el método Open() pues no genera ningún error así "CLAS_MOBILE.db" no exista, y tranquilamente ejecutas un CREATE TABLE:
- Private Sub CrearTablas(ByVal Cnn As SQLiteConnection) 
-         Using _Cmd As SQLiteCommand = Cnn.CreateCommand 
-              _Cmd.CommandText = "CREATE TABLE CMB_USUARIO (USU_USUARIO VARCHAR (8) NOT NULL,USU_PASS VARCHAR (8) NOT NULL,USU_ZONA VARCHAR (25) NOT NULL)" 
-              _Cmd.ExecuteNonQuery() 
-   
-             _Cmd.CommandText = "INSERT INTO CMB_USUARIO VALUES('usu01','123456','peru')" 
-             _Cmd.ExecuteNonQuery() 
-         End Using 
- End Sub  
despues podrias colocar en el evento load del form lo siguiente:
- cnn = New SQLiteConnection("Data Source=CLAS_MOBILE.db;Version=3;") 
- cnn.Open() 
- Try 
-      If (Not File- . Exists("CLAS_MOBILE.db")) Then
 
-          CrearTablas(cnn) 
-      End If 
- Catch ex As Exception 
-      MessageBox.Show(ex.Message, "Error") 
- End Try 
aquí todo el code:
- Imports System 
- Imports System.Data 
- Imports System.IO 
- Imports System.Data.SQLite 
-   
- Public Class Form1 
-     Public ruta As String 
-     Dim cnn As New SQLiteConnection 
-     Public consulta As String 
-     Private Sub Form1_Load(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles MyBase.Load 
-         cnn = New SQLiteConnection("Data Source=CLAS_MOBILE.db;Version=3;") 
-         cnn.Open() 
-         Try 
-             If (Not File- . Exists("CLAS_MOBILE.db")) Then
 
-                 CrearTablas(cnn) 
-             End If 
-         Catch ex As Exception 
-             MessageBox.Show(ex.Message, "Error") 
-         End Try 
-     End Sub 
-   
-     Private Sub Button1_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Button1.Click 
-   
-         If USUARIO.Text = "" Or PASSWORD.Text = "" Then 
-             MessageBox.Show("Debe Ingresar Usuario y Contraseña") 
-         Else 
-             Try 
-                 If (File- . Exists("CLAS_MOBILE.db")) Then
 
-   
-   
-                     consulta = String.Format("SELECT USU_USUARIO,USU_ZONA FROM CMB_USUARIO WHERE USU_USUARIO='{0}'", USUARIO.Text) 
-   
-                     Dim Ada As New SQLiteDataAdapter() 
-                     Dim Sqlstr As New SQLiteCommand(consulta, cnn) 
-                     Dim dr As SQLiteDataReader = Sqlstr.ExecuteReader(CommandBehavior.CloseConnection) 
-                     While dr.Read 
-                         Dim value As Object = dr.Item("USU_ZONA") 
-                         If value IsNot DBNull.Value Then TextBox1.Text = CStr(value) 
-                     End While 
-                     dr.Close() 
-                 Else 
-                     MessageBox.Show("No existe base de datos", "Error") 
-                 End If 
-             Catch ex As Exception 
-                 MessageBox.Show(ex.Message, "Error") 
-             End Try 
-         End If 
-     End Sub 
-   
-     Private Sub CrearTablas(ByVal Cnn As SQLiteConnection) 
-         Using _Cmd As SQLiteCommand = Cnn.CreateCommand 
-   
-             _Cmd.CommandText = "CREATE TABLE CMB_USUARIO (USU_USUARIO VARCHAR (8) NOT NULL,USU_PASS VARCHAR (8) NOT NULL,USU_ZONA VARCHAR (25) NOT NULL)" 
-             _Cmd.ExecuteNonQuery() 
-   
-             _Cmd.CommandText = "INSERT INTO CMB_USUARIO VALUES('usu01','123456','peru')" 
-             _Cmd.ExecuteNonQuery() 
-         End Using 
-     End Sub 
- End Class 
-   
-   
Nota: Yo usaria un Select Count para comprobar usuario y un ExecuteScalar para recoger el valor devuelto si es cero el usuario no existe y si es 1 pues si.
Saludos y suerte!!!!!!!!!