Si los subtitulos estan insertados en video entonces NO SE PUEDEN QUITAR ya que forman parte del video igual cualquiera de los personajes que salgan en dicho film e igual que no puedes quitar a un personaje tampoco puedes quitar los subtitulos. Ahora bien si los subtitulos no estan insertados sino que los tienes en un archivo aparte y desde ahí es desde donde los cargas en el reproductor del video (o el mismo reproductor los carga automaticamente) entonces puedes editar ese archivo de subtitulos para quitarle esos signos raros que te molestan usando para ello simplemente el propio notepad o si lo prefieres el subtitle workshop, aunque como ya digo el mismo notepad te vale perfectamente.

Despues si es tu deseo puedes insertar los subtitulos ya corregidos al video usando este manual https://foro.elhacker.net/multimedia/tutorial_insertar_subtitulos_en_avi_o_mpg-t21841.0.html para no tener que andar siempre cargando con el archivo de subtitulos.

Y bueno por ultimo si como te dije en un princpio los subtitulos ya estan insertados en el video (en este caso como ya te dicho no se pueden quitar) y por tanto no los puedes eliminar siempre puedes insertar nuevamente otros subtitulos (siguiendo el manual que te puse antes) que sean de mayor tamaño y de un color mas 'chillon' de modo que estos tapen casi totalmente a los subtitulos originales. Pero claro esta para eso tendrias que tener un archivo de subtitulos o crearle tu mismo con el subtitle workshop pero esta ultima opcion no es muy viable dado que eso supondria un enorme trabajo aun teniendo un poco idea del tema (del orden de alrededor de 10 horas por cada hora de duracion del video o puede que mas).

Todos los programas mencionados aqui o en el manual que te puesto los puedes descargar de la web de mi firma.
Saludos...

Songoku

Hola de nuevo , lo estoy intentando pero estoy teniendo algunos problemillas; te los comento por si me puedes ayudar  

Nada más abrir el video en virtualdub; me sale una pestañita que pone

"AVI: Variable bitrate (VBR) audio detected VBR audio in AVI is non-standard and you may encounter sync errors up to 9233ms when attempting to extract WAV files or processing the audio in Direct Stream Copy mode. Full Processing mode is recommended to decompress or recompress the audio, (bitrate: 155.8 ± 28.1 kbps)"

Como no sé si eso es malo o no, le doy a OK y continuo con los pasos

Le doy a audio, y cuando llego a compresion elijo MPEG Layer-3 y cuando le doy a Mostrar todo no me sale el bitrate recomendado, no sé cual elegir, elijo el más alto que me aparece (“56 kBit/s, 24,00 Hz, estereo).

Voy al video, marco "procesado completo" y cuando llego a comprsion elijo "Divx 6.9.2 Codec, (no tengo otro divx) , le añado los subtitulos  pero cuando le doy a guardar como, me sale:

"No audio decompressor could be found to decompress the source audio format, (source format tag: 0055) "

¿que hago mal?

Gracias lo he vuelto a intentar, y he seguido cada paso (aunque en vez de Divx5.1 he puesto divx6), y junto cuando voy a dar a guardar me sale un error:
me pone:

"error initializing audi stream conversion:
The audio codec cannot compress the source audio to the desire format.
Chek that the  sampling rate and number of channel in the source is compatible with the selected compresed audio"