hola! los sectores si ya están dañados en realidad no se reparan, se ubican y se evita escribir sobre ellos. igualmente siempre es recomendable hacer un chkdisk, ver como está todo, capaz una pasadita con /f (o -f, no recuerdo bien la sintaxis... es de fix, para reparar si es posible) y ya más tranquilo defragmentas en segundo plano.

te recomiendo también tomarlo como un hábito, si mueves mucha información hacerlo de manera programada una vez al mes más o menos. (hay casos que es necesario antes, las gráficas te muestran mucha información) saludos

No es que pierdas archivos, es que fatigas el disco al vicio... el problema se inicia por la forma que se guarda la información, en partes; cada vez que mueves borras etc vas generando "huecos" entre bloques que luego el sistema intenta completar con otro archivo... si es mas grande, lo fracciona y sigue en otro lado. Explicado desde el movil, y a lo bruto, eso es la fragmentación XD
Llega un momento que tienes tantos bloques separados indexados a un mismo archivo en la tabla que el disco anda como loco de un lado a otro, con la latencia que ello conlleva, y acortando su vida útil considerablemente.
Defragmentar es ir moviendo los bloques para unir o mas bien juntar los datos... como te darás cuenta, si el disco está muy lleno, o con poco espacio y muy fragmentado, se dificulta muchísimo la operación.
 Saludos

Si tu dices... aunque te vas a dar cuenta recién cuando hagas, sobre qué puedes comparar ahora si no tienes ninguna referencia en 6 años? es una herramienta más a disposición del usuario... pruébalo y me cuentas. Saludos!