hola dantemc1, el problema no es el uso o mal uso de una herramienta avanzada de partición en linux, el tema es la fragmentación de la partición de windows...
si redimensionas a pelo probablemente pierdas datos o quede inutilizable; deberías primero:
- defragmentar la partición desde windows para dejarla bien optimizada y asegurarte el espacio libre disponible,
- redimencionar con cualquier aplicacion (por ejemplo con gparted) y
- refinir las particiones para la instalación de linux.
(también tienes el comando ntfresize, permite redimensionar dinámicamente dezplazando los datos, no haría falta la defragmentación; el mismo viene por defecto tanto en knoppix como en otras distros)
mas info ->
http://en.wikipedia.org/wiki/Ntfsresizesaludos.
(agrego) recuerda que siempre puedes para tranquilidad tuya hacer una copia o clonado de la particion a redimencionar... solo tienes que tener la pecaución de que la partición de destino sea mayor que la de origen (si ya sé, pero he visto cada cosa, por apurados... después son los lamentos XD)
- sudo fdisk -l (lista las particiones y su contenido)
- sudo dd if=/dev/sda1 of=/dev/sdb1 bs=1M
(donde sda1 será la partición de windows y sdb1 la destino, por ejemplo)