Quien dice que no es honesto diseñar con Joomla o con cualquier otro software, cada uno tiene su "estrella", esta el que diseña web codificando html - css - php porque se le da bien y fácil, otros van por la parte gráfica y hacen excelentes sitios con todas las prestaciones necesarias para un buen funcionamiento, ahora que digas que eres ( Diseñador Web ) es solo tu experiencia y tus proyectos quien lo dirá.
El problema es que quien hace en Joomla el diseño porque tiene sabe hacerlo muy bien luego le pasa algo al Joomla (archivo corrupto, pérdida de permisos, actualización desastrosa, perdida de pass...) como no sabe de verdad diseñar/programar pasa lo que pasa que tiene que llamar a su amigo informático para que le salvo el culo.
Yo por ejemplo que se más o menos Joomla, termino antes haciendo una web desde 0 (o con template de themeforest para ganar tiempo) que usando Joomla, además de ganar en "velocidad, seguridad, usabilidad..." hay que recordar que Joomla no se creo para hacer webs.
Yo por ejemplo he creado un CMS (tipo Joomla) que es para hacer webs y administrarla con panel de control y al final el resultado puede llegar a ser que las consultas son 600 veces más rápidas que en Joomla...
Así que sí, importa mucho.