En el caso de documentos dinámicos que es supongo lo que quieres decir, el HTML y el CSS se quedan cortos, hay que recurrir a javascript, PHP y bases de datos.

Tienes una estructura y los huecos los rellenas con el contenido que almacenas en una base de datos. Sea este texto, imágenes, etc.

Dicho de otro modo, tu página tendría un contenido fijo, hecho en HTML, CSS y lo que se tercie (puede que javascript).

Ahora bien ¿como sabe tu página web que debe de acceder a una base de datos para recuperar el contenido deseado y ponerlo organizado dentro de tu documento?

Normalmente con PHP (hay otras opciones, pero es de las mas simples). Ese contenido PHP tiene la particularidad de que lo escribes, pero no se ve nunca en el navegador porque es un contenido que se ejecuta en el servidor y genera nuevo código HTML dentro del ya existente, pudiendo generalmente como parte de ese proceso acceder a un servidor de bases de datos donde almacenas el contenido deseado