por que todos llegan preguntando por "el mejor", para todo lo que pides no sería "el mas adaptable", "el mas practico" o en si defecto "el mas seguro"? (que lo mas probable es que no este ni cerca de caer en las 2 clasificacioned anteriores) que probablemente el mas seguro ni la nsa pueda con el (por lo menos no antes.del interrogatorio)

Y cual seria el mas seguro en estos momentos?

Es muy comun de la gente de la ultima generacion ^_^ (o del que no sabe del tema )

Que tipo de encripcion necesitas? Para todo el disco? Con clave o con archivo de llave?

De hecho Windows tiene uno muy bueno que se llama Bitlocker, sin tu clave no se puede facilmente abrir el sistema..

Sino tenes la reencarnacion de TrueCrypt: CipherShed

O lo que queres es que te pida una contraseña para abrir X archivo solamente? (que es a lo que suena)

Aparte para que la encripcion se pueda leer desde Windows o desde Linux ya seria hablar de algo como LUKS o algo asi.. O sino bueno Truecrypt tambien esta para ambos sistemas.. Tambien CipherShed..