Comparto una solución a un problema que llevaba teniendo unos días:

Recientemente, me ha empezado a ocurrir que ciertos ficheros generados por programas "desaparecían" sin más, a pesar de que el programa decía claramente que habían sido guardados.

Tras investigar cierto tiempo, encontré que todos estos ficheros iban a parar a un directorio llamado "Virtualstore", que se encuentra en:


En mi caso sería, por ejemplo:

Aparentemente, Windows hace esto para evitar que los programas interrumpan su actividad al no tener permisos para guardar el fichero en la posición escogida y así no perder la información.

Para solucionar este problema, es tan sencillo como arrancar el programa con privilegios de administrador. (Click derecho>Ejecutar como Administrador)

Esto dará a la aplicación los permisos necesarios para poder guardar el archivo en el lugar apropiado.

Si se confía en la aplicación, también se puede configurar en propiedades (Clic Derecho>Propiedades>Compatibilidad>Ejecutar este programa como administrador) para que se ejecute con permisos siempre.

Fuente: http://www.sevenforums.com/general-discussion/222389-what-virtual-store-folder.html

Se crea sobre todo cuando utilizas programas con cierta antigüedad en cuentas de usuario limitadas.
En mi caso, el primer programa que me dió el problema fue DVD Shrink 1.6