hola cmjesus, bueno normalmente yo miro en una consola el regedit a ver las claves run y run once (por si no hay inicios de dichos procesos) y en el msconfig; luego borro las carpetas si las tengo ubicadas y paso el ccleaner limpiando las dll's huérfanas navegadores etc (justamente ayer un amigo necesitaba eliminar el malware sweet.page, lo hice de esta forma), o bien directamente desde el desinstalador del mismo.

hay otros específicos para desinstalación, pero no recuerdo ninguno en este momento como destacable del resto.

saludos