Es demasiado "concreto" lo que quieres hacer, seguramente lo tendras que programar tu, ya que una herramienta para hacer eso... no la conozco

Necesitas programarlo tú, Y para identificar un color  en la pantalla entera necesitas usar algoritmos que yo jamás llegaré a conocer xD, En fin, complicado, complicado........

Lo fácil es clickar en un sitio, Lo dificil es identificar el color exacto, Y la posicion (coordenadas) del pixel donde se encuentra ese color. Como va a existir algo así xD

PD: A mi se me ocurre una manera, Pero muy rústica, OCR.
Hay un OCR libre que hace capturas (Elijes el tamaño de la captura) y automáticamente traduce el texto de la imagen, Bueno, Pues digo yo que como es opensource podrías adaptarlo (RE-PROGRAMARLO) para reconocer colores, y no texto, no se! Y con eso ya tendrías algo de trabajo hecho. El nombre del programa OCR no lo recuerdo, pero lo ví aquí: www.addictivetips.com
Búscalo en el buscador si quieres, Que te saldrá el primero.

Salu2!

Con Autoit lo puedes hacer en unas lineas... y hay la leche de tutoriales pues les suelen utilizar para...

xD

Saludos