Tengo una duda, quiero entrar en la deep web pero quiero saber cuales son las mejores medidas de
seguridad que debo tomar. Algun consejo?

Nada en especial, navegador Tor ya viene con las protecciones necesarias, por ejemplo NoScript

Pero claro, si te descargas algo y lo ejecutas... mejor que sea en una máquina virtual xD

Lo siento, pero eso lo veo una tontería.