hola que tal, e tenido un problema q no logro entender cual  es su causa.

if [$line=$(ls -1 | head -n1)]

tengo esta sentencia  y no encuentro la vuelta para hacer que se evalué bien. El error que me tira bash es el siguiente;

alguien me puede aclarar porque pasa esto? como tendría q ser la sintaxis para q no tire error?.

Sí, en el if los corchetes no deben de ir juntos, ¿por qué? ammmm, no lo sé, pero lo que sí te puedo decir es que "[" es una característica interna del shell, por lo que si pusieras [ALGO no se reconocería.