MI duda es simple, hay alguna forma de comparar dos cadenas ignorando parte de ellas, es decir:

CADENA= "pez.txt"

if cadena =="pez.*"

siendo el "*" la parte ignorada

el error que estas cometiendo no es en el condicional, sino en la lógica de los objetos que estas comparando, es como preguntar:
si casa es igual a ventana
que claro no lo es, entonces la pregunta más correcta sería:
si hay ventana en casa
y para eso hay muchas formas, ya te dieron dos, bueno modifico una y agrego dos más:

#-*- coding: utf -8 -*-
 
cadena="pez.txt"
 
if cadena[:3] == "pez":
    print("bien 1")
if "pez in cadena":
    print("bien 2")
if cadena.startswith("pez"):
    print("bien 3")
 
import re
encontrar=re.compile(r"pez")
 
if encontrar.match(cadena):
    print("bien 4")